本所是我国最早批准具有硕士与博士学位授予权的研究生招生和培养单位之一，也是中国科学院首批博士生重点培养基地，具有“地质学”和“地球物理学”两个一级学科（理学）的学位培养点以及 “地质资源与地质工程”一级学科（工学）和“海洋地质”二级学科（理学）的学位培养点；可以在此范围内招收和培养硕士与博士研究生。 

　　同时，由研究所牵头正在实施增设中国科学院大学行星科学一级学科博士学位培养点，目前已通过中国科学院大学审批，研究所已设立行星内部物理学、行星空间物理学、行星地质学、行星化学、行星表面环境、天体生物学等相关研究方向。 

　　研究所现有研究生导师321人，包括博士生导师129人（其中中科院院士15人、中国工程院院士1人、国家杰出青年基金获得者38人、国家优秀青年基金获得者20人）、硕士生导师151人、院内或院外兼职博士生导师31人、兼职硕士生导师10人。研究所专业设置齐全，具有交叉、融合的特点，注重培养多学科、多专业协同作战的研究能力，宽泛专业基础知识的掌握和进行综合性研究工作的高水平专业人才。目前在读研究生678人，包括博士生467人（含留学生21人）、硕士生211人。2000年以来共毕业研究生2539人，其中博士毕业生1604人。 

　　研究所每年通过高校优秀毕业生推荐免试及全国统考招收80名左右学术型硕士研究生，通过推免生直接攻博、所内硕士生转博及公开招考招收90名左右博士研究生。