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1998年4月作为首席科学家启动、主持国家攀登预选项目(95-预-39):地质流体作用及其成矿效应研究;
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1997年1月获得国家杰出青年科学家基金项目“流体/岩石反应体系中的微量元素地球化学”资助;
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2000年8月作为首席科学家启动中国科学院重要方向创新项目:“西南乌江流域物质的水文地球化学循环及其环境效应”;
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2004年11月作为首席科学家启动中国科学院重要方向创新项目“喀斯特典型小流域土壤-植被系统生源要素的生物地球化学循环及其生态环境效应”;
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2006年~2010年中国科学院海外合作伙伴计划“地表地球化学过程与环境效应”负责人;
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2006年~2010年国家重点基础研究发展计划项目:“西南喀斯特山地石漠化与适应性生态系统调控”首席科学家;
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2007年~2010年 国家自然科学基金重点项目“乌江水能开发对流域水环境影响的因素辨识及其表征体系研究”负责人;
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2007年~2010年 中国科学院西部行动计划项目“西南喀斯特生态系统退化机制与适应性修复试验示范研究”负责人;
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2008年~2010年 国家基金委创新研究群体项目“西南喀斯特流域物质循环的生物地球化学过程与生态环境效应”负责人;
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2010年至今 中国科学院知识创新工程重要方向项目“中国大陆主要流域风化(侵蚀)与碳循环——地表水地球化学研究”负责人;
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2011年至今,自然科学基金委重点项目“气候因素控制下的花岗岩风化成土过程和风化壳物质迁移转化规律—Li、B和Si同位素示踪研究”负责人;
- 2012年至今,自然科学基金委重大国际合作项目“青藏高原及其东部周边剥蚀风化过程的构造-气候等控制机理和全球变化意义研究”负责人;